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植物根系掃描系統的WinRHIZO軟件可以讀取TIFF，JPEG標準格式的圖像。針對獲取的圖像，利用插入解密的軟件，同時配合廠家針對掃描儀配置的Scanner.cal校準文件，對掃描獲得的高質量根系圖像進行分析。

植物根系分析系統利用高質量圖形掃描儀獲取高分辨率植物根系彩色圖像或黑白圖像，該掃描儀在掃描面板下方和上蓋中安裝有專門的雙光源照明系統，并且在掃面板上預留了雙光源校準區(qū)域。

植物根系圖像分析儀FT-V800是一套用于洗根后的專業(yè)根系分析系統，可以分析根系長度、直徑、面積、體積、根尖記數等，功能強大，操作簡單，軟件可分析植物根系的形態(tài)，色彩、分級伸展分析及根系的整體結構分布等等。廣泛運用于根系形態(tài)和構造研究。

植物冠層分析儀可廣泛應用于農業(yè)生產和農業(yè)科研，為進行冠層光能資源調查，測量植物冠層中光線的攔截，研究作物的生長發(fā)育、產量品質與光能利用間的關系，本儀器用于400nm－700nm波段內的光合有效輻射（PAR）測量、記錄,測量值的單位是平方米·秒上的微摩爾（μmols㎡/秒）。

植物冠層分析系統采用的是對冠層下天穹半球圖像分析測量冠層孔隙率的方法，該方法是各類方法中準確和省力、省時、快捷方便的方法。